稻妻地区的秘境入口分布在多个岛屿，包括借景之馆、千门虚舟、砂流之庭等。借景之馆位于踏鞴砂右上方沙滩礁石处，初始被岩壁遮挡，需使用附近的崩炮击碎岩壁才能进入。千门虚舟位于荒海地下，需完成一笔画机关解谜并激活两个地底机关后解锁。砂流之庭、菫色之庭等秘境则直接显示在地图上，通过传送锚点可快速抵达。部分秘境需完成前置任务，例如踏鞴物语任务链才能解锁借景之馆。
荒海水下秘境的开启需先传送到荒海地面锚点，跳入中央深井进入水下隧道。激活所有元素方碑后，从隧道右侧游至对岸启动魔方机关，秘境之门会从地底升起。清籁岛秘境需完成前置任务清风徐来，并在特定时间段使用风神瞳激活传送门。恶王亭秘境则需先完成世界任务远古羽氏遗事·其三以解除区域雷雨，随后点燃四个火把解锁机关。
部分秘境入口隐藏较深，例如阵代屋敷需通过雷种子引导或特定角色技能触发。稻妻城地底的秘境通常需解谜或击败守卫才能进入，例如通过雷立方解密或击败遗迹机兵。清籁岛沉船秘境需搜寻线索并解除源泉控制，随后激活旋转机关并按顺序放置水晶球。秘境内部常含多层结构，需注意观察环境细节，如隐藏的梯子或破碎木板。
探索时建议优先完成相关世界任务，如踏鞴物语远吕羽氏遗事等。任务会提供秘境线索并解锁必要工具，如崩炮或雷种子权限。部分秘境入口仅在任务推进后显现，例如水月池秘境需先完成外部雷指针解谜以降低水位。若遇到无法交互的秘境，可检查任务列表或回溯周边区域是否有未触发的机关。
稻妻秘境的奖励包括原石、天赋素材、圣遗物等，挑战难度与解谜复杂度正相关。炼武秘境砂流之庭掉落武器突破素材，精通秘境菫色之庭提供角色天赋材料。秘境机制多样，例如椛染之庭需击败特定敌人或限时通关，建议提前配置适合的队伍。
