多个忍者的组合技能以其突出的伤害数值著称，例如秽土三代的雷水龙弹、忍战樱的跃起砸地、宇智波斑的武士幻影斩击以及红夜带土和忍战带土的系列组合技，这些技能在命中后往往能造成远超普通技能的高额伤害。三代雷影的核心组合技地狱突刺·二本贯手在雷铠状态的加持下，爆发伤害极为惊人，其机制要求通过技能积攒充能点来强化释放，抓取过程附带无敌帧并能有效压制霸体忍者，是纯粹以高伤闻名的代表。宇智波鼬通过天照与月读的衔接能打出爆炸组合伤害，而重吾的蓄力一拳和C忍希的一套完整技能连招也具备在特定条件下瞬间清空血条的潜力。组合技伤害的排行一直是玩家探讨的焦点，不同忍者的组合技因其独特的数值设定和命中方式，在实战中展现出毁伤能力的差异。
这些高伤害组合技通常拥有一些共同特征，它们往往需要玩家以特定顺序或同时按下两个技能键来触发，而非简单的技能先后释放。为了平衡其高伤害效果，多数组合技在释放后会使涉及的两个技能同时进入冷却，这意味着一旦释放落空或时机不当，会面临较长的技能真空期，容易被对手反击。部分组合技在造成高额伤害的还兼具强力的控制效果，如抓取、击飞或定身，确保伤害能够稳定打满。也有些组合技更注重纯粹的爆发，例如在角都的技能体系中，通过触手攻击与多属性忍术的联动，也能玩出高爆发的天花板操作。
在实战中充分发挥这些高伤害组合技的威力，关键在于释放时机与节奏的把控。不能盲目使用组合技，必须根据战斗时的具体状况来决定，例如在成功控制住敌人或预判对手没有替身术时释放，以确保其高伤害不会落空。玩家需要熟练掌握每个忍者的技能机制，例如三代雷影需要合理管理能量点，在开启雷铠获得霸体和减伤的窗口期内打出组合技，以实现伤害最大化。佩恩的组合技则依赖于万象天引抓取后衔接神罗天征来打满伤害，对技能衔接的流畅度要求很高。自来也的速切组合技更是需要精确的结印操作与技能顺序，通过黄泉沼、通灵术与火焰螺旋丸的连贯释放实现不间断的高伤灌顶。
尽管高伤害组合技极具威慑力，但玩家也需认识到其潜在的风险与代价。由于组合技会消耗两个技能的冷却，一旦使用就需要承担后续一段时间内攻击手段减少的风险。某些组合技，如秽土三代的水遁雷遁组合，虽然伤害很高但控制力不足，前摇明显，如果贸然使用很容易被对手躲过并陷入被动。将组合技融入整体战斗策略尤为重要，它更适合作为终结连招或关键一击来使用，而非开场就随意交出的起手技能。搭配能够提供起手或保护能力的秘卷、通灵兽，可以更好地为释放高伤组合技创造安全环境。对忍者技能机制的深度理解、精确的能量管理与冷静的战场判断，才是将这些高伤害组合技转化为胜利的关键。
